Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC71Q8IV32 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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