Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML1Q86YW5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms