Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms