Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms