Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNS3Q68CZ2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms