Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDCA8Q53HL2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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