Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms