Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms