Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms