Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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