Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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CTF1Q16619 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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