Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCSK7Q16549 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms