Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZNF56Q15929 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms