Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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