Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNIP1Q15025 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms