Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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