Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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