Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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SHROOM2Q13796 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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SHROOM2Q13796 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHROOM2Q13796 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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