Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTP4A2Q12974 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
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