Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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