Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms