Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC18A2Q05940 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A2Q05940 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms