Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7AQ04656 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7AQ04656 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms