Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DEFA6Q01524 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms