Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms