Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYBPC1Q00872 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms