Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPNP63162 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms