Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms