Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP4P49662 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP4P49662 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP4P49662 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP4P49662 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms