Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTBP49356 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms