Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXLNAP40222 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TXLNAP40222 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms