Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LTBRP36941 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LTBRP36941 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LTBRP36941 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LTBRP36941 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms