Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXA9P31269 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXA9P31269 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms