Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCAP28676 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms