Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRB3P28472 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms