Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms