Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTX3P26022 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms