Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BCL3P20749 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BCL3P20749 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BCL3P20749 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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