Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DMDP11532 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DMDP11532 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DMDP11532 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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