Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC4P09017 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms