Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB1P08034 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms