Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PRM2P04554 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms