Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN3O75935 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms