Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ULK1O75385 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ULK1O75385 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ULK1O75385 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ULK1O75385 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ULK1O75385 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms