Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms