Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCAO15360 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCAO15360 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.9 ms