Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNPHO15079 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNPHO15079 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SNPHO15079 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SNPHO15079 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SNPHO15079 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNPHO15079 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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