Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN8O00124 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms