Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN25C9JDP6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms