Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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C4orf47A7E2U8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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